研究了特殊微生物对不同连作系统根际微生物的影响。使用具有不同连续作物障碍的土壤作为培养基。施用2％特殊微生物肥后，进行辣椒土壤培养实验，根际土壤稀释平板计数和PCR-DGGE分析。结果表明，随着土壤连作障碍物的增加，细菌和放线菌数量减少，真菌数量增加。施用微生物肥后，土壤微生物群体密度显着变化，土壤连作障碍物轻，中度，重组菌数量增加78.6％，66.7％，54.5％，真菌数量减少5.0％ 12.5％，7.5％，放线菌数量增加了18.2％，9.1％，23.5％。通过对PCR-DGGE指纹图谱的分析，发现根际土壤微生物丰度和多样性指数随生理土壤连续作物障碍物的增加而降低。施用微生物肥后，微生物群落数和群体结构发生变化，指数增加。结果表明，微生物肥料对根际土壤微生物群体密度和群体结构有显着影响，但由于土壤连续作物障碍水平不同越来越多的关注已经付诸于可持续农业，并且使用微生物对土壤的生态修复已经受到越来越多的关注。近年来，学者从生态恢复的角度，发现根际微生物的不平衡，微生物群落结构的不平衡可能是连作障碍的主要原因。探讨克服土壤微生物群落结构问题的措施，重建土壤微生物系统的动态平衡，克服土壤连续作物障碍的问题。有机肥在土壤连续作物障碍的应用可以显着增加根际土壤中微生物的数量和活性，优化土壤微生物菌群。有机肥的应用，特别是有机肥与生物防治菌和生长促进菌的结合，有机肥施用后，生物防治菌和促进菌可利用有机肥中的营养促进生物防治菌在根围的植物，以发挥生物防治功能，效果更好，引入菌根真菌和拮抗菌，致病微生物竞争空间和营养，稳定有益的微生物群落结构和群体数量，实现土壤微生物区域的监。从农产品安全的角度，通过微生物有机肥配方和生产技术的改进和应用方法的优化，可以更好地实现土壤连作障碍和土壤传播疾病防治效果。
