生物肥料的研究和应用始于20世纪50年代的中国。 早期的生物肥料研究主要集中在固氮菌，解磷菌和解钾菌，其目的是提供更多的氮，磷和钾。 经过60多年的发展，生物肥料已经发展成为中国的一个巨大的产业，有1000多个生产企业和11个产品，其中多功能品种占了很大的比例。
生物肥料就其肥效功能而言，在我国农业生产中使用最为普遍的主要有5 类：
一、根瘤菌生物肥料
氮抑制和竞争结瘤，能力差是限制根瘤菌作用的重要因素。 研究如何提高根瘤菌与土着根瘤菌之间的竞争结瘤能力，提高根瘤菌抗氮抑制能力，是提高其固氮能力的关键技术。
根瘤菌与土壤，豆科植物种类有效配合，有利于提高根瘤菌对土壤环境的适应能力和固氮能力。
加强对高效根瘤菌生物防腐剂的研究，提高根瘤菌的保质期和土壤生存能力。
二、联合固氮菌生物肥料
固氮菌肥和氮肥一起配合使用可以减少大部分氮肥使用量。小白菜接种固氮鞘氨醇单孢菌，植株干重增加206%，含氮量增加230%。青海试验示范推广联合固氮菌菌剂，川水地区小麦增产8.45%～16.8%，脑山地区增产4.77%～22.9%，沙地、薄地小麦拌种固氮菌增产33%，青稞上应用联合固氮菌(拌种) 增产13.0%～18.4%。
三、溶磷菌生物肥料
磷肥增溶微生物肥料或配制剂在粮食，蔬菜等经济作物的实验室模拟实验和现场实验中取得了令人鼓舞的进展。 大量使用肥料，特别是磷肥，会影响接种溶磷微生物，增加土壤不溶性磷的利用率。 国家要重视高效解磷微生物菌株的筛选和产品开发，提高土壤磷素资源的有效利用率。
四、解钾菌生物肥料
钾溶解是钾溶解菌株效力的重要指标。 一些钾释放菌株对不溶性钾具有较好的活化作用。硅酸盐菌株有良好的产量和疾病抑制。 硅酸盐细菌的接种使盆栽玉米植物的地上干重分别增加了31.9％和26.7％。 硅酸盐细菌菌株的接种导致对尖孢镰刀菌85.9％的抑制作用。 泡盛曲霉和黑曲霉的接种能有效提高玉米植株的磷，钾含量和生物量; 迟缓芽孢杆菌接种的烟草增加了2倍的鲜重; 巨大芽孢杆菌，大肠杆菌。 大幅度提高山地大豆的效果
五、促生菌生物肥料
为了适应农产品商业化生产带来的土壤环境问题，我国农业微生物学研究人员筛选了一些产生植物生长促进物质的菌株。
有广泛的微生物具有促进细菌对芽孢杆菌最为常见的作用，包括巨大芽孢杆菌，枯草芽孢杆菌，枯草芽孢杆菌，解淀粉芽孢杆菌，芽孢杆菌，粘质芽孢杆菌，地衣芽孢杆菌，荧光假单胞菌等。 通过优化这些菌株的组合，开发了一些功能性生物肥料来抵抗疾病并促进生长。
目前，全国生物肥料企业增加到1000个，产品类别11个，生物肥料产量1200万吨。 生物肥料在粮食绿色安全和减少化肥使用方面具有非常大的意义。 随着化肥零使用与绿色环保的不断推出，土壤质量的提高，农田土壤肥力的提高，农田土壤污染的治理，必将加速生物肥料在我国肥料应用市场的扩大。 全国现有耕地面积为16亿亩。 按照生物肥料的总用量和每亩50公斤的计算，每年至少需要8000万吨生物肥料。 这将是一个巨大的肥料市场。
